1. Oktober 2025

Klinische, biologische und technische Disziplinen vereint im Kampf gegen die Antibiotikakrise

Zur Halbzeit des Nationalen Forschungsschwerpunkts (NFS) AntiResist arbeiten rund 40 Labore intensiv daran, neue Strategien gegen antibiotikaresistente Erreger zu entwickeln. Eine zentrale Grundlage dafür liefern mehrere Kliniken mit mehreren tausend biologischen Proben und zahlreichen Datenpunkten zur Diagnose und Behandlung infizierter Patientinnen und Patienten.

Das Projekt zeigt eindrücklich, wie Informationen aus dem Klinikalltag für die Grundlagenforschung genutzt werden können und untermauert die Wichtigkeit des interdisziplinären Forschungsdatenmanagements. Dieses wird an der Universität Basel seit mehreren Jahren intensiv gepflegt und mit einem Data Stewardship Programm gefördert.

Daten von hoher Qualität und Sicherheit

Am DKF wie auch am Biozentrum stellen mehrere Data Stewards aus diesem universitären Netzwerk sicher, dass die klinischen Daten effizient, regulatorisch konform und technisch sicher den Forschungslabors zur Weiterverarbeitung zugeführt werden. Es werden beispielsweise Standards für Datenerhebung und Datentransfer, für Qualitätskontrollen und Datenschutzmassnahmen wie De-Identifizierung und Verschlüsselung festgelegt und deren Einhaltung begleitet.

Infektionsmechanismen besser verstehen

Im Labor konnten die zahlreichen klinischen Proben und Daten der vergangenen Jahre bereits erfolgreich für die Entwicklung von in-vitro Modellen genutzt werden. Es wurden Modelle für Lungen-, Blasen-, Blut- und Plazentagewebe entwickelt, die sich physiologisch sehr ähnlich verhalten wie Gewebe von infizierten Patientinnen und Patienten. In diesen Modellen werden nun die für bestimmte Erreger spezifischen Infektionsmechanismen erforscht, mit dem Ziel neue antibiotische Behandlungsstrategien zu entwickeln. Es werden natürliche und synthetische Wirkstoffe getestet, aber auch unkonventionelle Ansätze wie Anti-Biofilm-Wirkstoffe oder der Einsatz von Bakteriophagen verfolgt.