Bisher wurden in der Antibiotikaforschung pathogene Bakterien im Labor gezüchtet und anschliessend untersucht – unter optimalen, aber künstlichen Bedingungen. Neue technische Entwicklungen ermöglichen die Untersuchung von Bakterien innerhalb der natürlichen Umgebung, also direkt im infizierten menschlichen Gewebe. Dieses stammt bei AntiResist von Patientinnen und Patienten aus dem USB, die aufgrund einer Infektion behandelt werden. Der Ansatz lautet nun vom «Patient zum Medikament» statt traditionell «vom Medikament zum Patient».

Erprobt wurde dieser in der mittlerweile abgeschlossenen PROSA Studie (siehe rechts). Diese hat als Pilotstudie wichtige Erfahrungswerte geliefert für die Etablierung der Abläufe und Voraussetzungen bei der Datenerfassung, Datenweitergabe und Datenauswertung der auf Staphylococcus aureus analysierten Gewebeproben. Denn der neue Forschungsansatz bringt eine Reihe von Herausforderungen mit sich und benötigt innovative Datenlösungen.

In den letzten Monaten sind in der Zusammenarbeit der Forschungsgruppe mit dem USB Clinical Data Warehouse, dem Biozentrum und dem DKF grosse Fortschritte in der Erfassung und dem Aufbau der komplexen Datenstruktur und der Daten Infrastruktur gemacht worden. All diese Erfahrungen werden nun ins NFS AntiResist Projekt eingebracht, mit dem Ziel, weitere Bakterien zu untersuchen und mit klinischen Outcomes zu verknüpfen. Konkret wird die PROSA Studie derzeit ausgeweitet auf weitere Erreger: E. coli, P. aeruginosa und K. aerogenes.

Langfristig ist es das Ziel von AntiResist, auf der Basis all dieser Daten, neue Therapie-Optionen zu entwickeln und in klinischen Studien zu untersuchen.